公元25世纪，地球人口极度膨胀，资源被消耗殆尽，自然环境恶劣至极，原本的春夏秋冬变成只有了极热和极寒两季。人类只得搭载宇宙飞船，开始在茫茫宇宙中寻找另一个栖息之地。
经过数百年的星际流浪，人们终于发现了一个宜居的小行星，科学家们给它取名为光明星，并在此建设了新的家园。在光明星中，科学家们发现了一种含有惊人能量的神奇晶石——“源晶”，并将其用作高效的动力能源，建设了空中城市伊甸之城。人类的科技文明到达了前所未有的高度，新的科技时代已然降临。
然而此时，一股黑暗的势力正在悄然潜入，危害着来之不易的安宁。因地托城的源晶研究所因一场未知原因的能量暴动，几乎毁于一旦。
我们希望玩家们你们作为优秀的星航军，前往调查。研究所中，失控的智械，被困的研究人员，离奇失踪的伊万斯博士，声称要重塑世界的神秘机甲人，将让你们陷入了层层迷雾之中……
为了挫败神秘机甲人的阴谋，你们需要在星航军团总部的协助下，陆续前往圣伊斯海岛、X3号基地等地区保护几大源晶，挫败神秘机甲人的阴谋。
  作为守护世界和平的星航军，相信你们能担起重任，斩破暗夜，迎接黎明。